Lungo la costa della Puglia si avvicendano, partendo dal nord, tratti rocciosi nel Gargano, falesie più o meno alte a sud di Bari e nell'estremo sud del Salento, il tutto intervallato da litorali sabbiosi. La regione è in gran parte pianeggiante e collinare con alcune sub regioni differenti: il Gargano e il Subappennino Dauno sono le uniche zona montuose della Puglia, il Tavoliere delle Puglie, le Murge, le Serre Salentine, la Terra di Bari, tra la Murge e il mare Adriatico, la Valle d'Itria. Alla Puglia appartiene l'arcipelago delle Tremiti, le isole Cheradi, e l'isola di Sant'Andrea.